用螢幕保護程式研發抗癌藥物
作者:Andy Patrizio
發表於 Mon, 2001-09-24 15:00
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搜尋潛在癌症治療藥物的虛擬超級電腦,將會有令人滿意的結果。
晶片廠商英特爾與分散式運算公司聯合器材(United Devices)正以更快的速度,從備選的藥物中搜尋潛在癌症治療藥物。
從自4月份開始該計畫後的5個月內,英特爾-聯合器材癌症研究專案已經確認了60,000種可能抑制癌細胞生長的分子。
這種英特爾-聯合器材軟體是一種類似SETI@Home和Folding@Home的螢幕保護軟體,它所搜尋的是包圍癌細胞、並抑制其繁殖的分子。
該專案研究了16種已知會導致癌症的蛋白質,它試圖將35億種能夠包圍它們的分子相配。
聯合器材一開始研究1百萬種分子,但是該軟體可以模擬35億種分子變體。
僅5個月內,該軟體已經對16種蛋白質中的2種和35億種分子作了完整的測試,並發現40,000種分子能和其中一種癌蛋白匹配;20,000種分子則可和另外一種癌蛋白相配。
聯合器材表示,該軟體每秒分析17,000種分子。大部份的大型醫藥公司每週能分析10,000種分子就算不錯了。
「我們相信這將改變藥物的發現,不僅可針對治療癌症的藥物,其他藥物也一樣可做。」 國家癌症研究基金會(National Foundation for Cancer Research)的科學主任貝(Sujuan Ba)博士表示。該專案是由該基金所資助的。
她補充說:「未來,隨著專案的擴大,我可預見還能發現與老年癡呆症、糖尿病等相關的其他蛋白,我們還有許多蛋白有待分析。」
貝博士指出,分散式運算使醫藥研究人員獲得了前所未有的有效工具。
她說:「從前,計算化學的局限在於電腦的運算能力,隨著平行計算技術的發展,你可以在同一時間做更多計算。」
聯合器材原打算在上週於英國牛津的癌症會議上宣佈其發現,但因發生紐約和華盛頓的恐怖攻擊而導致會議被取消。
該專案參與者有556,000人,參加工作的電腦共有935,000台。這是繼Seti@Home之後的第二大分散式運算專案。
多虧志願者的參與,該專案獲得了相當於50,000年的處理器時間(CPU time)。今年底前可望完成另外6種癌蛋白的測試。
牛津大學(Oxford University)化學系主任、國家癌症研究基金會英國辦公室主任理查?(Graham Richards)博士表示,分散式運算可能減少十幾年的新藥研發時間。
「在獲得可出售的藥物之前還有很長的一段路要走。」他說,「從開始研究到藥物用於臨床性實驗可能長達12年,這在我們的預計中只是頭2年而已。」
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